Science:从介导层面解析为何“**有别”

2022-02-07 01:13:18 来源:
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已经有的研究成果表明,许多多样的全人类突变,除此以外疾病,都表现出有群体差异的特征。这些群体差异被不同层面地并不认为皮质醇、性染色体、突变×男性波动、行为差异和环境渗入的差异。然而,至今为止,它们的必要和基本人类学定律在很大层面上仍然是未被发现的。

突变-该组织解读(GTEx)项目提供了一个希望,让我们可以通过研究成果许多以前未曾以这种方式总括的该组织,来探求全人类激活组中的群体差异的一般性和基因组突变必要。

最近,研究成果工作人员在ScienceMagazine发文。为了总括全人类激活组及其调节的群体差异,并发掘出男性和基因组突变学如何两者之间互冲击多样的表现型和疾病,研究成果工作人员在GTEx项目(v8数据发布)调查报告的44个全人类该组织来源中的生成了基因组解读及其基因组突变调节的群体差异目录,并量化了16245个RNA测序样本和838个成年群体的突变。

在此基础上,研究成果工作人员报告了基因组解读水平、该组织细胞类型组成和顺式解读定量分析表现型基因组座(cis-eQTLs)的群体差异。为了评估它们的冲击,研究成果工作人员将这些结果与87个GWAS的基因组机制、激活变异联结注释和全DNA相似之处研究成果(GWAS)汇总统计两者之间联结。

结果表明,男性对基因组解读的冲击是无处不在的 (在所有该组织中的,研究成果工作人员深入研究了13 294个有群体差异的基因组)。然而,这些冲击很小,而且主要是该组织酪氨酸的。

具备群体差异解读的基因组主要不是由该组织酪氨酸基因组解读涡轮机的,而是参与了一系列多元化的人类机制,如药物和代谢反应、演化过程和该组织形体发生、受精卵、性生殖和精子发生、脂肪代谢、乳癌和免疫反应等。

而X连接基因组在男同性恋中的解读很高,定时了付出代价X染色体失活的候选基因组,常以染色体基因组的男性偏向性解读定时了与代谢两者之间关的激活变异调节和额外激活变异的依赖性,以及表观基因组突变学标记的群体差异性分布,特别是组蛋白H3 Lys27三甲基化(H3K27me3)。

基因组解读的基因组突变调节的群体差异要少得多(在所有该组织中的深入研究出有了369个男性偏向的eQTL),并且具备高度的该组织酪氨酸。研究成果工作人员发掘出了58个由单一男性的基因组解读基因组突变调节涡轮机的基因组-表现型相似之处。这些除此以外群体差异的细胞类型轻元素介导突变-突变相似之处的基因组座,以及男性似乎在相似之处的潜在分子必要中的起着更直接依赖性的基因组座。例如,研究成果工作人员在脾脏中的发掘出了一个男同性恋酪氨酸的六酪氨酸HKDC1的eQTL,它冲击怀孕男同性恋的代谢,随后看出有在后裔的出有生体重上。

因此,通过将GTEx数据的男性意识量化与基因组机制和激活变异联结注释两者之间联合,研究成果工作人员描述了导致全人类激活组和eQTLs群体差异的该组织酪氨酸和该组织共享的涡轮机主因和必要。

研究成果工作人员发掘出了多个群体差异的基因组解读波动,这些波动与多样的表现型基因组突变相似之处乘积,从而促进了GWAS波形的机理解读。

由于许多突变的致病该组织是未被发现的,因此对多元化的GTEx该组织抽取的量化可以作为调查报告男性偏倚表现型基础的强大能源。这项工作对全人类激活组的群体差异及其基因组突变调节展开了广泛的总括。

原始出有处:

Meritxell Oliva et al. The impact of sex on gene expression across human tissues. Science (2020). DOI: 10.1126/science.aba3066

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