Nat Biotechnol：研究不能重复？可能是HeLa细胞系“变异”了

HeLa细胞核已经在全世界的许多检验室指导了近70年，并且直到现在被指出是无限自给自足的不变异的大致相同细胞核。然而，2年末18日刊出在《Nature Biotechnology》杂志上的一项新研究工作表明，细胞核在极为大致相同检验室相互间存在很大相似之处，这引发了对细胞核则有研究工作以此类推性的严厉批评。“我很高兴看到这项研究工作，但在举例上我极为感到惊讶，”斯隆丹尼尔莎癌症中所心的底物生物化学家Prasad Jallepalli问道，他没有参与这项研究工作。这极为是HeLa细胞核则有自诞生以来第一次造出现大众化的报道：多年来，其他研究工作小组也证明了了HeLa细胞核人形体内形体相互间在基因组序列和RNA理解的相比较相似之处。这项最近研究工作首次全面分析了各种HeLa人形体内形体的遗传人形体内（极为大致相同批次的HeLa细胞核则有境遇在全世界的各个检验室），并且首次证明了遗传异质性导致了蛋白质理解和表型的推移。HeLa细胞核“变异了”？在这项研究工作中所，研究工作人员从6个国际组织的13个检验室收集了14份HeLa比对，并在大致相同的检验室条件下进行指导。他们首先计量了基因组拷贝数人形体内，揭示了它们基因组组相互间的相比较相似之处。结果发掘出，HeLa人形体内形体相互间，除此以外是CCL2和Kyoto人形体内形体相互间存在着不小的异质性。进一步的分析表明，许多这些遗传相似之处产物为mRNA产生的推移，并且在相当大程度上产物为蛋白质丰度的推移。研究工作人员报告问道，HeLa CCL2和Kyoto细胞核则有的转录组和蛋白质组谱彼此相互间的相似之处，就像来自两种极为大致相同子类组织的肿瘤细胞核则有相互间的相似之处一样。HeLa人形体内形体在指导全过程中所生长速度也极为大致相同，一些细胞核集合只能17.5星期才能少于，而另一些细胞核在大致相同的指导条件下只能话费最多32星期。它们对沙门氏菌染病的反应也有所极为大致相同：与其他两种变异形体相比，一种变异形体对染病的敏感性较低，研究工作人员将其归因于低水平的蛋白质核酸，这种蛋白质核酸在细菌进入宿主细胞核中所起起着。在一项分开的检验中所，研究工作小组通过指导细胞核则有三个年末，来观察HeLa人形体内形体的基因组理解是否才会随着时间发生推移。研究工作人员记录了后期细胞核和末期细胞核相互间基因组理解相似之处大约6%。苏黎世联邦政府理工学院底物则有统生物化学所长的Ruedi Aebersell教授是该研究工作的合着者，他问道，“即使在同一个检验室里，这些细胞核的相似之处和推移速度也是极其惊人的。”他估计，如果一个研究工作生在项目开始时用HeLa细胞核则有继续做了一个检验，并在六个年末后被要求以此类推这个检验，他们意味著才会得到极为大致相同的结果。关于研究工作中所的“可遗传物质性巨变”的探讨大多数集中所在检验设计、数据分析方面的弱点，以及作为主要驱动因素的受污染或贴歪标签的细胞核则有。但是Aebersell指出，HeLa细胞核则有和肿瘤细胞核则有的生物化学相似之处意味著是关键。为什么才会“变异”？斯坦福大学的细胞核生物化学家Tim Stearns指出有几个意味著的可能可以表述为什么细胞核则有在长时间指导下才会发生推移。首先，HeLa细胞核是已知基因组组稳定肿瘤细胞核，因此很意味著随时间随机性状异。此外，它们还才会在检验室中所受到各种生长条件的影响，这意味著才会日后细胞核进化造出契合的形态。例如，他问道，灵长类动物细胞核的指导包括将其指导到充满着一个指导皿为止，从指导皿中所得来一部分细胞核，然后将它们放在另一个指导皿中所生长，这一全过程称为对立。“每个人继续做这件事的方法都看似极为大致相同，”他问道道。最近这些发掘出，对于生命体指导细胞核的研究工作结果的表述和重现性有一定的内涵。Aebersell和他的同事在文章中所提造出异议了几个具形体的解决方案。首先，研究工作人员无论如何用于肿瘤细胞核则有的后期传代，并确保在同一细胞核则有的极为大致相同比对中所以此类推同一细胞核则有的检验。更重要的是，生物化学家无论如何清楚地报告他们在集合的研究工作中所用于的细胞核则有人形体内形体。